Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cldn34c1Q8K193 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cldn34c1Q8K193 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cldn34c1Q8K193 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Cldn34c1Q8K193 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c1Q8K193 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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