Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms