Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Snx8Q8CFD4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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