Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc28aQ8CEI3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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