Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcinQ8CDE2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms