Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms