Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nhlrc3Q8CCH2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Nhlrc3Q8CCH2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Nhlrc3Q8CCH2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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