Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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