Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ctdsp2Q8BX07 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ctdsp2Q8BX07 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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