Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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