Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ubash3bQ8BGG7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ubash3bQ8BGG7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Ubash3bQ8BGG7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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