Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htatsf1Q8BGC0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Htatsf1Q8BGC0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Htatsf1Q8BGC0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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