Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed4Q80WQ9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms