Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pcsk9Q80W65 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms