Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SnupnQ80W37 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms