Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Avl9Q80U56 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms