Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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