Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms