Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sbno2Q7TNB8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sbno2Q7TNB8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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