Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms