Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssx9Q6XAS3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ssx9Q6XAS3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssx9Q6XAS3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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