Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GcsamQ6RFH4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms