Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp49Q6P9L4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp49Q6P9L4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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