Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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NipblQ6KCD5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NipblQ6KCD5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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