Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tpm4Q6IRU2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms