Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smarca2Q6DIC0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms