Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fndc3c1Q6DFV6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fndc3c1Q6DFV6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms