Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms