Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Jmjd1cQ69ZK6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms