Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Pkp4Q68FH0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp4Q68FH0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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