Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms