Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc8eQ66JT1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc8eQ66JT1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrc8eQ66JT1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc8eQ66JT1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc8eQ66JT1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrc8eQ66JT1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrc8eQ66JT1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc8eQ66JT1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc8eQ66JT1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms