Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Polr2kQ63871 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms