Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ift52Q62559 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms