Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rbm38Q62176 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Rbm38Q62176 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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