Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxj1Q61660 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxj1Q61660 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms