Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msi1Q61474 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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