Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
JrkQ60976 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms