Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms