Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bbs12Q5SUD9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms