Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms