Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms