Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim58Q5NCC9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trim58Q5NCC9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Trim58Q5NCC9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Trim58Q5NCC9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms