Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank3Q4ACU6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms