Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam220aQ3ZN08 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms