Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacs2Q3V3Q7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms