Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Smim9Q3V0X1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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