Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lrrc43Q3V0L5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrc43Q3V0L5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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