Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Prr7Q3V0I2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prr7Q3V0I2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms