Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q3USZ8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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